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中南大學(xué)團(tuán)隊(duì)研發(fā)孤獨(dú)癥譜系疾病診斷新技術(shù)

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中南大學(xué)團(tuán)隊(duì)研發(fā)孤獨(dú)癥譜系疾病診斷新技術(shù)

日前,論文《脆性X綜合征的綜合分析:長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序全面解析FMR1基因變異”》在國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊“Clinical Chemistry”《臨床化學(xué)》在線發(fā)表。

此項(xiàng)研究成果是中南大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)研究中心的鄔玲仟、梁德生教授課題組攻克。脆性X綜合征(FXS)是智力障礙和孤獨(dú)癥譜系障礙中最常見(jiàn)的單基因病,男性發(fā)病率為1/4000,女性發(fā)病率為1/6000-1/8000。95%的FXS患者由FMR1基因5’端非翻譯區(qū)的(CGG)n三核苷酸重復(fù)序列擴(kuò)增引起。女性前突變(55-200次CGG重復(fù))攜帶者的CGG區(qū)不穩(wěn)定,在向后代傳遞過(guò)程中有很大幾率(約80%,CGG重復(fù)數(shù)越高幾率越大)擴(kuò)展為全突變,以致生育FXS患者。

由于女性前突變攜帶率高達(dá)1/200-1/600,對(duì)育齡或早孕期女性進(jìn)行攜帶者篩查是最好的防控手段。而前突變攜帶者罹患脆性X相關(guān)疾病的風(fēng)險(xiǎn)也會(huì)增加:男性主要有震顫/共濟(jì)失調(diào)綜合征,女性主要有原發(fā)性卵巢功能不全和神經(jīng)精神障礙等。因此,精準(zhǔn)的基因篩查和診斷對(duì)于FXS的防控至關(guān)重要。

FXS的基因變異十分復(fù)雜且類(lèi)型繁多,迄今缺少全面、精準(zhǔn)且高效的基因檢測(cè)手段。由于(CGG)n超高GC含量的影響,一代和二代測(cè)序均無(wú)法有效檢測(cè),目前臨床常規(guī)采用三重復(fù)引物 PCR 法和DNA印跡雜交法,但檢測(cè)(CGG)n長(zhǎng)度受限,且無(wú)法判斷AGG打斷的位置和數(shù)量,而AGG打斷對(duì)患者預(yù)后判斷和后代風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)十分重要。

中南大學(xué)課題組開(kāi)發(fā)了一種長(zhǎng)片段PCR(LR-PCR)與三代測(cè)序結(jié)合的FXS綜合分析(CAFXS)新方法,一次性檢測(cè)(CGG)n擴(kuò)增、AGG打斷、基因內(nèi)SNVs、Indels、微缺失和大片段缺失等全部變異類(lèi)型,同時(shí)檢出低至0.5%的前突變及全突變低比例嵌合體,真正實(shí)現(xiàn)FXS的全面、精準(zhǔn)、高效的基因篩查和診斷,檢測(cè)成本也已接近常規(guī)方法,臨床回顧性試驗(yàn)證明靈敏度和特異性達(dá)到99.9%,具有廣闊的臨床應(yīng)用前景。

據(jù)悉,鄔玲仟、梁德生團(tuán)隊(duì)在遺傳病的基因診斷和產(chǎn)前診斷新技術(shù)臨床應(yīng)用研究領(lǐng)域處于國(guó)際前沿。

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