通過對不同研究結果的歸納分析可以確定出一些連鎖的常見區(qū)域。IMGSAC報道的2號染色體的特定區(qū)段多點的MLS達到3. 72.最近，針對阿斯伯格綜合征基因定位的首次全基因組掃描結果顯示，在1號、3號、13號染色體上有一些有趣的區(qū)域，這些區(qū)域與之前報道過的孤獨癥連鎖區(qū)域是重疊的。7號染色體上也有一些連鎖的證據通過數種標記被找到了。

令人鼓舞的是，數個染色體區(qū)域的連鎖具有明顯的證據。然而，這些區(qū)域的定位太大（如在7號染色體上），所以，研究員們不得不試圖通過減少表型檢查的項目來縮進臨床與遺傳異質性間的距離，如只檢測強迫行為或語言障礙來提高連鎖定位的信號。類似的問題是，在男性中更高的孤獨癥發(fā)病率表明性別因素在孤獨癥易感性中有所影響。然而，并沒有遺傳學研究的證據表明X染色體上的基因在孤獨癥患者中起主要作用。

近期的針對患病雙胞胎的性別分析表明之前所發(fā)現的區(qū)域連鎖顯示出一種特殊的性別相關效應。IMGSAC的樣本中，16號染色體的連鎖只存在男性雙胞胎上，7號染色體上也有相同的趨勢但達不到統(tǒng)計學意義。在此樣本中，15號染色體的連鎖只存在非男性ASP中，但目前尚不清楚在女性孤獨癥患者中，15q11-q13位點的染色體異常頻率是否上升。

在類似于炎癥性腸病、高血壓、糖尿病和神經質人格障礙這類復雜疾病的研究中，依賴于患者性別效應的基因連鎖在早前也有所報道。這些結果表明此方法具有實際意義，并且對于觀察其他具有相似性別偏差的神經發(fā)育性疾病，尤其是小樣本量會影響統(tǒng)計顯著性時，此方法也有效。

對于從假陽性中查找微小效應的可信位點，繼續(xù)收集大家系樣本是非常必要的。孤獨癥家系數據的增長，如孤獨癥遺傳資源交流數據庫（AGRE）和柯瑞爾孤獨癥研究數據庫，對于此方面是非常有利的?；疾‰p胞胎家系數據的增長能夠更好地確證陽性的連鎖，找到更多在小家系樣本中找不到的連鎖，并減少整個基因組中的“噪聲”水平。

數項研究發(fā)現了非連鎖的孤獨癥易感性位點間產生相互作用而致病的證據。這說明對于從復雜疾病中查找致病基因的定位而言，此方法比單點定位分析要有效的多。

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